流式细胞仪被用于观察血小板的功能或活化状态。例如可应用荧光素偶合的Echiststin，标记血小板膜糖蛋白受体抗体，观察糖蛋白受体占领的情况。
表1 血小板膜糖蛋白受体及其配体
表2 免疫检测用血小板特异的抗体
1．血小板膜GP IIb/IIIa：已开发出不同的单克隆抗体，使我们能够区分开血小板GP IIb/IIIa受体静息、活化和配体占领后的不同状态。
PAC-1，针对活化的血小板GP IIb/IIIa受体的抗体，能识别GP IIb/IIIa受体的纤维蛋白原结合部位。
LIBS抗体，针对活化、而且被配体结合后的血小板GP IIb/IIIa受体的抗体。
抗RIBS，配体诱发的结合部位抗体，针对与血小板GP IIb/IIIa受体结合，形态发生改变了的纤维蛋白原的抗体。
2．血小板膜GPIb/IX/V：凝血酶激活的血小板表面GPIb受体复合物内化，抗体结合减少，因此，体内凝血酶活性增强可以用GPIb受体表达下降来监测。
3．颗粒标志物：使用抗thrombospondin和抗P-选择素抗体，来监测释放出来的a颗粒；抗GP53结合主要反映血小板溶酶体的分泌情况。
4．血小板-白细胞聚集：使用共聚焦显微镜检测循环血小板-白细胞聚集物，反映粘附到白细胞的活化血小板。使用流式细胞仪，在CD14阳性的白细胞上面结合的血小板特异的CD42免疫荧光，作为血小板-白细胞聚集物的标志。此结合激活白细胞，细胞表面粘附受体（如MAC-1）或L-选择素表达增强。
5．血小板膜受体的遗传学分析：限制性片断长度分析允许对血小板糖蛋白受体进行多态性分析，另外也可利用等位基因特异的抗体，用流式细胞仪分析GPIIb/IIIa的多态性。据研究认为，GPIIIa的PIA多态性与血栓和心脏事件有关。
平均血小板体积也是预测心肌梗死后反复缺血事件的独立危险因子。
血小板活化状态被用来对急性冠脉综合征、介入治疗后和心肌梗死存活者等的危险分层。